Học viện Y Dược Cát Lâm được thành lập năm 1952, tiền thân là Học viện Quân y Cát Lâm của quân giải phóng nhân dân Trung Quốc. Tháng 8 năm 2004, thông qua sự phê chuẩn của Quốc vụ viện và Bộ quốc phòng, trường
Tính đến tháng 5 năm 2013, diện tích của trường là hơn 50 vạn m2. Thư viện của trường có hơn 120 vạn đầu sách cùng 1337 chủng loại sách báo giấy, 20 loại sách ngoại văn.
Học viện Y Dược Cát Lâm có 9 khoa , 3 đơn vị và 6 bệnh viện trực thuộc. Trường có 568 giảng viên chuyên ngành với gần 9000 sinh viên đang theo học
Tính đến tháng 5 năm 2013, Đại học Y Dược Cát Lâm đã thiết lập mối quan hợp tác với nhiều trường đại học, bệnh viện từ hơn 10 quốc gia trên toàn thế giới như Mỹ, Anh, Australia, Nhật Bản, Hàn Quốc, Ấn Độ, Philippin và Singapore.